Aislamiento Y Caracterizacin̤ De Las Secuencias Ltr De Retrotransposones Del Grupo Ty1 Copia En Phaseolus Vulgaris
Resumen del Libro
El uso de nuevos marcadores moleculares relacionados con las regiones codificantes del genoma es importante para desarrollar diferentes estudios en diversidad, mapeo, ligamiento genťico y filogenia. Debido al hecho de que los retrotransposones Ty1-copia parecen estar muy relacionados con las regiones codificantes (Flavell et al., 1998, Kunze et al., 1997, Pearce et al., 1996, Sandmeyer et al., 1990, Waugh et al., 1997), us ̤la tčnica desarrollada por Pearce et al., 1999, para aislar secciones RNAsa-LTR del genoma de Phaseolus vulgaris. De una librera̕ de ms̀ de 1000 clones se secuenciaron 45 fragmentos, de los cuales 24 mostraron la secuencia del retrotransposn̤ esperada. Las 24 secuencias fueron clasificadas en agrupamientos homogňeos que no son modificados al introducir secciones homl̤ogas de retroelementos de otras leguminosas. Adicionalmente, se diseąron cebadores que inclua̕n secciones del tracto de polipurina aislado para encontrar las relaciones de las regiones corriente abajo de esto motivo. De una librera̕ de 1920 clones se secuenciaron 72 fragmentos, de los cuales 37 tena̕n el par de cebadores esperados. Las relaciones de estos LTRs muestran una poblacin̤ altamente heterogňea que es congruente con las altas tasas de mutacin̤ de estas regiones en los retroelementos. El anl̀isis de las secuencias de los LTRs aislados mostr ̤poca conservacin̤ en los motivos requeridos para la transcripcin̤, pero el clon L814-90 tiene altos porcentajes de conservacin̤ en todos sus motivos. Los cebadores diseądos se utilizaron para realizar pruebas preliminares con las tčnicas de SSAP e IRAP, lo cual mostr ̤que los retrotransposones pueden ser t︢iles para estudios a nivel intraespecf̕ico o ingterespecf̕ico.
